プロポリスの原塊には、不純物が含まれていますので、プロポリスを抽出する際には、それを取り除き、アルコールなどを使用して殺菌します。
このように、プロポリスの製造過程においては、とくに問題になるものはないといえますが、近年では、プロポリスが作られる環境面で憂慮することがいくつか考えられます。
農場や果樹園で農薬を散布している場合、その近くにミツバチの巣箱が設置されていると、農薬が混入してしまう可能性がありますし、砒素や重金属に汚染されている土壌で樹木が育っている場合、植物がそれらに汚染されて、樹脂を通じてプロポリスに混入する危険性もあります。
プロポリスについては、砒素や重金属の検査、有機塩素系や有機リン系の代表的な邦訳の検出検査をおこなっている製品ですと、より安全に服用できます。

